Родился 28 августа 1838 года в Антверпене.
С детства интересовался изучением растений. Учился в иезуитском училище в Алсте, затем — в Королевском Атенеуме.
С 1858 года Ван Хёрк вместе с де Бёккером начал систематическое изучение флоры окрестностей Антверпена, впоследствии они вместе основали Антверпенское травное общество.
В 1859 году Ван Хёрк начал самостоятельное изучение диатомовых водорослей.
В 1861 году Ван Хёрк отправился в Бонн, где учился у профессора Германа Шахта (нем.)русск. анатомии растений и технике создания микропрепаратов.
С 1867 года Ван Хёрк преподавал химию в школе в Антверпене.
В 1869 году Ван Хёрк стал почётным доктором Ростокского университета.
С 1877 года он был директором Антверпенского ботанического сада.
В 1882 году Ван Хёрк впервые использовал электрический свет для работы с микроскопом.
В 1891 году в Королевском Атенеуме он организовал Международную выставку микрофотографии.Скончался 13 марта 1909 года. Через два дня была опубликована его последняя работа по диатомовым — Diatomees de l"Expedition antartique Belge.