Он поступил на службу в качестве солдата в Нёйстрийский полк 20 октября 1788 года.
В 1792 году служил в пехоте Легиона Аллоброгов. Став адъютантом генерала Карто, участвовал в осаде Тулона.
В Итальянской кампании 1796-97 годов сражался в рядах дивизии Бернадотта, командуя эскадроном 1-го гусарского полка. Отличился в ходе боёв в районе Неаполя в 1799 году.
В Итальянской армии командовал авангардом в дивизии Ватрена, после чего стал начальником штаба правого крыла армии Италии, и служит под началом генерала Сульта.
В ходе обороны Генуи был ранен и захвачен в плен. По окончании боевых действий служил в 4-м военном округе в Меце.16 октября 1806 года получил под своё командование 9-й гусарский полк, бывший командир которого, Жан Барбанегр, погиб в сражении при Йене.
В новой должности Готрен отличился в битве при Фридланде 14 июня 1807 года, где был ранен. Отличился при Ваграме. 21 октября 1809 годам произведён в бригадные генералы, и возглавил 10-ю бригаду лёгкой кавалерии Итальянской армии.25 декабря 1811 года его бригада получила 11-й порядковый номер, и вошла в состав 3-го корпуса резервной кавалерии. Готрен хорошо проявил себя в ходе Русской кампании 1812 года, и 11 октября был награждён орденом Почётного легиона (коммандан). 11 ноября, обессиленный при отступлении, он попадает в плен. Вернулся во Францию только 6 августа 1814 года.По возвращении с острова Эльба, Император 5 апреля 1815 года отдаёт под начало Готрена бригаду в составе 5-й дивизии наблюдательного корпуса Мозеля, который позднее стал 4-м корпусом Северной армии. Сражался при Ватерлоо.
С 1 октября 1815 года без служебного задания.
В 1818 и 1819 года участвовал в различных кавалерийских инспекциях. 23 мая 1825 года получил звание генерал-лейтенанта.
В марте 1831 года ушёл с активной службы, а 1 апреля 1833 года окончательно вышел в отставку.