1986—1988 — старший научный сотрудник НИИ Автоматизированных систем управления при Госплане СССР1988—1991 — заведующий лабораторией НИИ статистики Госкомстата СССР1991—2002 — заведующий отделом, заместитель директора Центра исследований и статистики науки Минпромнауки России и РАНС 2002 года — первый проректор НИУ ВШЭ, директор ИСИЭЗ НИУ ВШЭ Леонид Гохберг является одним из ведущих в России специалистов по экономике, статистике и прогнозированию науки, технологий и инноваций, исследованиям научно-технической и инновационной политики, долгосрочному прогнозированию научно-технологического развития и Форсайт-анализу[en] (на базе возглавляемого им института действует единственный в России Форсайт-центр).
В НИУ ВШЭ курирует блок прикладных исследований. Под его руководством выполнено более 250 исследовательских проектов в сфере развития науки, инноваций, ИКТ и образования по заказам российских органов власти, крупных компаний, институтов развития, Европейской Комиссии, Евростата, Организации экономического сотрудничества и развития, ЮНЕСКО и проч.Является одним из разработчиков перечня Приоритетных направлений развития науки, технологии и техники в РФ и Перечня критических технологий РФ, утверждённых российским президентом и правительством. Соавтор прогноза по важнейшим направлениям научно-технологического развития России до 2030 года.Член ряда международных экспертных групп и советов по инновационной политике и прогнозированию. Соруководитель экспертной группы № 5 по обновлению «Стратегии 2020» .Главный редактор и соавтор ежегодных статистических сборников по индикаторам состояния науки, инноваций, информационного общества и образования в России.Автор более 300 научных публикаций, изданных в России, Великобритании, Франции, Германии, США, Корее, Венгрии, ЮАР, Болгарии и других странах.