Глогер родился в Гродкуве (ныне Польша). Изучал с 1824 года естественные науки в Берлине и Вроцлаве.
В 1830 году он получил учёную степень кандидата наук. Во время учёбы он уже занимался исследованием птичьего мира Исполиновых гор.
В 1830 году он был преподавателем во Вроцлаве и одновременно членом Немецкой академии натуралистов Леопольдины, штаб-квартира которой находилась с 1878 года в Галле.
В 1843 году Глогер переехал из Вроцлава в Берлин, где работал в Зоологическом музее Берлина и руководил изданием журнала по орнитологии «Journals fur Ornithologie» .Глогер получил мировую известность благодаря вышедшему в 1833 году сочинению «Das Abandern der Vogel durch Einfluss des Klimas» (Влияние климата на изменчивость птиц), в котором сформулировал правило Глогера. Кроме того, он впервые построил ящики, соответствующие виду летучих мышей, и выработал структурные различия между ласточками и чёрными стрижами.