Родился 9 апреля 1880 года в селе Аркадак Саратовской губернии.Окончил физико-математический факультет Московского университета (1906). Ученик А. Н. Сабанина. По окончании университета был оставлен на кафедре агрономии сверхштатным лаборантом.Был избран заведующим кафедрой почвоведения Московских высших Голицынских сельскохозяйственных женских курсов.
В 1923 году Геммерлинг был назначен заместителем директора Научного института по удобрениям, а в 1924 году — директором Государственного почвенного института Народного комиссариата земледелия. Эти посты Владимир Васильевич занимал по совместительству, основным местом работы он всегда считал кафедру почвоведения.
В 1929 году В. В. Геммерлинг был избран членом правления Московского университета, в 1934—1935 годах являлся членом Высшей аттестационной комиссии, в 1936—1938 годах был деканом почвенно-географического факультета, а в 1938—1939 годах — деканом геолого-почвенного факультета (в 1941—1943 годах — в Ашхабаде, затем в Свердловске).
В 1945—1950 годах он организовал комплексную Волго-Донскую экспедицию по изучению междуречья и долин рек (в связи со строительством Волго-Донского канала).Умер 16 августа 1954 года в Москве.