Родился 28 мая (9 июня по новому стилю) 1865 года в родовом поместье на станции Ясенки Тульской губернии (по другим данным — в городе Старый Оскол Курской губернии).
В 1889 году окончил химическое отделение Санкт-Петербургского технологического института со званием инженера-технолога.
С августа 1890 года работал лаборантом на кафедре технологии органических веществ Харьковского технологического института (ныне Харьковский политехнический институт).
С марта 1893 года был штатным преподавателем черчения в этом же институте.
В 1894 и 1898 годах Джонс участвовал в работе съездов русских естествоиспытателей и врачей в Москве и Киеве.
В 1900 году посетил Всемирную выставку в Париже, где знакомился с достижениями в области химической технологии органических веществ.
В 1900 году Валентин Джонс получил приглашение профессора Е. Л. Зубашева для работы во вновь открывавшемся Томском технологическом институте (ТТИ, ныне Томский политехнический университет; Зубашев был первым руководителем Томского технологического института). 1 августа 1900 года Джонс был назначен штатным преподавателем по начертательной геометрии и черчению.
В январе 1902 года он был командирован на полтора года за границу для подготовки к профессорской деятельности и занятия кафедры. Во время командировки работал в химических лабораториях профессоров Шторха в Копенгагене, Оствальда в Лейпциге, Бунга в Карлсруэ, Ульцера в Вене. Результаты своей командировки были доложены на заседании Физико-химического общества Харьковского университета, а затем в ТТИ и в статье «Испытательные станции кожевенного производства в Западной Европе» .
С 1 августа 1903 года Джонс исполнял должность экстраординарного профессора по кафедре химической технологии органических веществ ТТИ, в 1903—1910 годах был деканом химического отделения ТТИ. Несколько лет был председателем, членом испытательных комиссий химического и других отделений, членом хозяйственного комитета института.
В 1907 и 1911 годах участвовал в работе Менделеевских съездов, преподавал начертательную геометрию на Высших сибирских женских курсах и геометрию на вечерних общеобразовательных курсах.Кроме преподавательской, занимался общественной деятельностью — был членом Томского губернского кустарного комитета, членом Общества вспомоществования учащимся города Томска.
В 1911 году входил в состав экспертной комиссии Первой сельскохозяйственной и промышленной выставки в Омске.
В начале 1914 года Валентин Николаевич в связи с тяжелым заболеванием лёгких, подал прошение об отставке и был уволен со службы 30 апреля 1914 года в чине коллежского советника. Уехал жить на юг России, в начале 1920-х годов работал в Краснодаре в Кубанском сельскохозяйственном институте (ныне Кубанский государственный аграрный университет), где преподавал химию, химическую технологию, технологию жиров, начертательную геометрию. Был деканом одного из факультетов.Умер в 1931 году.Имел награды Российской империи: ордена Св. Станислава 3-й (1898) и 2-й (1909) степеней, Св. Анны 3-й степени (1904); медали «В память царствования Императора Александра III» , «В память 300-летия царствования Дома Романовых» .Интересно, что В. Н. Джонс более двадцати лет был знаком с великим русским писателем Львом Николаевичем Толстым, часто бывал в его доме, когда посещал свое поместье Ясенки, располагавшееся поблизости от Ясной Поляны.