Кристиан Георг Брюггер родился 11 марта 1833 года в коммуне Курвальден кантона Граубюнден. Учился в школах в Бриге, Куре и Санкт-Галлене, затем поступил в Мюнхенский университет. Посещал лекции Отто Зендтнера по ботанике, затем перешёл в Инсбрукский университет.
В 1859 году Брюггер был назначен куратором ботанического музея при Цюрихской политехнической высшей школе, работал там до 1870 года, когда занял место профессора естественной истории и географии в Кантонской школе Кура.
До своей смерти Брюггер был директором естественнонаучных коллекций Рецийского музея в Куре.Кристиан Георг Брюггер скончался в Куре 16 октября 1899 года.Гербарий К. Г. Брюггера разделён между Королевскими ботаническими садами Кью (K) и Лейденским университетом (L).