Гертруда Берлингем родилась 21 апреля 1852 года в городе Мексико штата Нью-Йорк.
В 1898 году получила степень магистра наук в Сиракузском университете. Несколько лет преподавала в Средней школе Восточного района Бруклина. Затем работала в Нью-Йоркском ботаническом саду.
В 1908 году получила степень доктора философии в Колумбийском университете.
В 1934 году ушла на пенсию и переехала в город Уинтер-Парк во Флориде. Берлингем скончалась 11 января 1952 года в своём доме в Уинтер-Парке.Гербарий Гертруды Берлингем, состоящий из свыше 10 000 образцов грибов, хранится в Нью-Йоркском ботаническом саду.