Представитель семейства выдающихся датских учёных, многие из которых работали в области медицины. Его сыновья: врач, математик и богослов Томас Бартолин (1616—1680) и математик и врач Расмус Бартолин (1625—1698); внук — анатом и политик Каспар Бартолин (младший) (1655—1738). Среди его родственников было 12 профессоров Университета Копенгагена.
С детских лет проявлял необыкновенные способности, в трёхлетнем возрасте научился читать, в 13 лет опубликовал речь на греческом и латинском языках.
В 1603 году поступил в Копенгагенский университет, позже продолжил обучение в университетах Ростока и Виттенберга, где изучал сперва богословие и филологию, а потом медицину.Затем совершил ряд путешествий по Германии, Голландии, Англии, Франции и Италии, и был принят с подчеркнутым уважением в разных университетах, которые он посетил.Некоторое время занимался медицинской практикой в Виттенберге.
В 1611 году был приглашён в Копенгаген для занятия кафедры красноречия.
В 1613-м, кроме того, стал профессором медицины. Преподавал медицину в течение 11 лет. Тяжело заболев, приготовился к смерти и дал обет, что в случае чудесного выздоровления посвятит всего себя службе Богу и теологии.После наступления выздоровления Каспар Бартолин стал в 1624 году профессором богословия Копенгагенского университета и каноником города Роскилле. Первым среди медиков описал работу обонятельного нерва.Его сочинение «Anatomicae Institutiones Corporis Humani» , написанное в 1611 и переведенное на немецкий, французский, английский и индусский языки, долгое время служило во многих университетах руководством при изучении анатомии.Примечания^ Перейти к: 1 2 Encyclopdia Britannica
^ Перейти к: 1 2 Немецкая национальная библиотека, Берлинская государственная библиотека, Баварская государственная библиотека и др. Record #122144880 // Общий нормативный контроль (GND) — 2012—2016.