Фридрих Готтлиб Бартлинг родился в Ганновере 9 декабря 1798 года.
Он получил образование в подготовительном лицее родного города.
В 1816 году в возрасте 18 лет Бартлинг уехал в Гёттинген изучать естественные науки.Его учебный план был очень обширен, но его деятельность была сосредоточена главным образом на ботанике, в интересах которой он ещё студентом много путешествовал по Венгрии и Хорватии к Адриатике.
Он был профессором ботаники в Гёттингене, а также главой местного ботанического сада.Фридрих Готтлиб Бартлинг умер в Гёттингене 19 ноября 1875 года. Фридрих Готтлиб Бартлинг специализировался на семенных растениях.