Роберт Элмер Балабан родился 16 августа 1945 года в Чикаго. Родители — Элмер (1908—2001) и Элеанора Балабан. Отец владел несколькими кинотеатрами, а позднее стал одним из пионеров кабельного телевидения. У отца Роберта было семь братьев, и все они так или иначе были связаны с театром или кинематографом. Двое из них основали театральную корпорацию Balaban and Katz, а также Барни Балабан, один из дядек Роберта, был президентом Paramount Pictures с 1936 по 1964 год. Бабушка и дедушка Роберта по отцовской линии — Августа Мендебурская и Израиль Балабан — были эмигрантами из России.Высшее образование Боб Балабан начал получать в Университете Колгейт, где был членом братства Фи-Каппа-Тау (Phi Kappa Tau), затем перевёлся в Нью-Йоркский университет.Впервые на телеэкранах Роберт появился в 1965 году в небольшой роли одного эпизода сериала «Хэнк» , впервые на широком экране зрители увидели его в 1969 году в ленте «Полуночный ковбой» , тогда же он сократил своё имя до Боб.
К 2013 году Боб Балабан снялся в более чем 90 фильмах и сериалах, срежиссировал почти четверть сотен картин, в десяти стал продюсером, а к семи написал сценарии.1 апреля 1977 года женился на писательнице Линн Гроссман, две дочери: Мэрайя (род. 1977) и Хазел (род. 1987).