Израиль Борисович Бабушкин родился 1 марта 1866 года в Киеве. Работал директором Садовского и Богатовского сахарных заводов Российской Империи.
В 1911—1912 годах Израиль Борисович Бабушкин по проекту архитектора М. Клуга на ул. Тверской, 7 построил хирургическую больницу и бесплатную амбулаторию.
Она была открыта для всех нуждающихся, как евреев, так и неевреев.Ночью 13 октября 1916 года, по предписанию высших военных властей, распорядившихся произвести у И. Б. Бабушкина и Ю. Г. Гепнера обыск и, независимо от результатов его было наказано их арестовать. Аресты Бабушкина и Гепнера произвел «ошеломляющее впечатление на киевских сахарозаводчиков и вызвали в городе сенсацию» ). Первое свидание с семьей Бабушкину разрешили только 5 февраля 1917 года, но следствие на то время ещё не окончилось. Его, как и других сахарозаводчиков, обвинили, что он немецки агент, но при министре юстиции Добровольском сфальсифицированное дело было прекращено «по Высочайшему повелению» . Осводождён Бабушкин был 22 февраля 1917 года.
В 1920 году после свержения власти царя и экспроприаций собственности эмигрировал во Францию.
В 1921 году основал «Paris-Banque» .Похоронен на кладбище Банье.