Манолис Андроникиос родился 23 октября 1919 года в вифинийской Прусе (сегодняшней турецкой Бурсе).
В 1923 году его семья, вместе с тысячами греческих беженцев из Малой Азии, нашла убежище в македонской столице, городе Салоники, где он и вырос.Андроникос окончил философский факультет Афинского университета и в 1952 г. стал профессором Классической археологии, Аристотелевского университета в Салониках. Позже он продолжил учёбу в Оксфорде (1954—1955), у известного профессора сэра Джона Бизли. Андроникос вернулся в Аристотелевский университет в 1957 году и в 1964 году стал его профессором. Андроникос проводил раскопки в Верии, Наусе, Килкис, п-ве Халкидики и в Салониках, но главным событием его жизни стали раскопки в Вергине.Умер Манолис Андроникос в Салониках 30 марта 1992 года.