Во время Великой Октябрьской революции был начальником сапёрного отряда.
В ноябре 1917 года вступил в ряды РСДРП (б). Участвовал в боевых действиях на фронтах Гражданской войны.
С 1923 года был на политической работе в Украинском военном округе.
С 1930 по 1934 годы был членом ЦКК КП(б)У.
В 1931 году был назначен на должность заместителя начальника, а в 1934 году — на должность начальника Политического управления Украинского военного округа. Одновременно с этим с 1934 года был членом Военного совета при народном комиссаре обороны СССР, с 1934 года — членом ЦК КП(б) Украины, в январе — июне 1934 года — кандидатом в члены, с июня 1934 года — членом Оргбюро ЦК КП(б) Украины, а с мая 1937 года — член Военного Совета Киевского военного округа.19 июня 1937 года армейский комиссар 2-го ранга Михаил Петрович Амелин был арестован в связи с показаниями заместителя председателя СНК УССР Ильи Савельевича Шелехеса.
В ходе следствия Амелин признал себя виновным и назвал как участников заговора 63 человека. 8 сентября 1937 года Михаил Петрович Амелин был приговорён к смертной казни и в тот же день расстрелян. 18 апреля 1956 года был реабилитирован.Жена Стефания Болеславовна (1904 — ) была приговорена Особым совещанием НКВД СССР 2 ноября 1937 года к 8 годам лагерей. 17 февраля 1956 года была реабилитирована.